TY - JOUR ID - 11009 TI - مطالعه پویش کل ژنومی صفات مرتبط با تولید شیر بر پایه تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعه‌های‌ ژنی در گاو هلشتاین JO - پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی) JA - AS LA - fa SN - 2008-5125 AU - عزیز پور, نوشین AU - خلت آبادی فراهانی, امیر حسین AU - مرادی, محمد حسین AU - محمّدی, حسین AD - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک AD - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز Y1 - 2020 PY - 2020 VL - 30 IS - 1 SP - 79 EP - 92 KW - پویش ژنوم KW - تولید شیر KW - امتیاز سلول‌های بدنی KW - آنالیز غنی سازی KW - گاو DO - 10.22034/as.2020.11009 N2 - زمینه مطالعاتی: اخیراً انتخاب به کمک QTLها و مناطق ژنومی مؤثر بر صفات تولیدی برای افزایش بازده انتخاب مورد توجه قرار گرفته است. هدف: پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش ژنومی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی­سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی ژن­های مؤثر بر صفات مرتبط با تولید شیر گاو هلشتاین با استفاده از تکنیک توالی­یابی GGRS بوده است. روش کار: بدین منظور، مطالعه پویش ژنومی از 1092 رأس گاو هلشتاین و رکورد مرتبط با تولید شیر، درصد چربی و امتیاز سلو­ل­های بدنی در برنامه Plink ارزیابی شد. آنالیز غنی­سازی ژنی با استفاده از بسته نرم افزاری goseq برنامه R و شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن­های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا از طریق پایگاه­های برخط GO، KEGG و Panther انجام گردید. نتایج: تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی نشان داد که مناطق ژنومی شناسایی شده به طور مستقیم و غیر مستقیم با ژن­های مؤثر بر امتیاز سلول­های بدنی، تولید و چربی شیر همپوشانی دارند. در این پژوهش تعداد 11 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزوم­های 5، 6، 7، 8، 14، 19، 22، 24، 25، 27 و 28 شناسایی شدند که با ژن­های ASIC2، ANXA3، CCL2، CCL11، CCL24،IL33،TLR3 ، WWOX،EGFR ،PRKCA ، CAMK2A،KCNMA1 ،FABP2 ،SPP1 ،THBS4 ، HSP90B1 وITPR1 مرتبط بودند. برخی از این ژن­ها در مناطق معنی­دار با مطالعه قبلی هم­خوانی داشت. در آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی تعداد 25 مسیر هستی شناسی ژنی و مسیر KEGG با صفات تولید و امتیاز سلول­های بدنی مرتبط بودند (P˂0.01). از این بین، مسیرهای positive regulation of inflammatory response و defense response نقش مهمی در سیستم ایمنی داشتند. همچنین در ارتباط با تولید و چربی شیر مسیرهای PPAR signaling pathway، Oxytocin signaling pathway و Focal adhesion ارتباط معنی­داری داشتند. نتیجه ­گیری نهایی: با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی صفات تولیدی، همچنین شناسایی مناطق ژنومی جدید استفاده از یافته­های این تحقیق می­تواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامه­های اصلاح نژادی گاو شود. UR - https://animalscience.tabrizu.ac.ir/article_11009.html L1 - https://animalscience.tabrizu.ac.ir/article_11009_5ebc7d8a90ef36b08e04224e449a17e5.pdf ER -